Sản xuất nông nghiệp ngày nay dần trờ thành tiêu điểm quan tâm không những trên phạm vi quốc gia mà còn trên qui mô toàn cầu. Sản xuất nông nghiệp Việt Nam đóng góp 24% GDP, 30% sản lượng xuất khẩu, tạo việc làm cho 60% lao động cả nước song rõ ràng sản xuất nông nghiệp lâu nay vẫn chưa chú trọng đúng mức việc bảo vệ môi trường. Sản xuất nông nghiệp sạch, nâng cao chất lượng nông sản nhằm đảm bảo vệ sinh an toàn thực phẩm và thân thiện với môi trường đang là mục tiêu phấn đấu của ngành nông nghiệp nói chung và nông dân nói riêng. Nhiều năm trở lại đây, việc sử dụng tràn lan phân bón và thuốc hóa học không những làm cho đất chai cứng, bạc màu mà còn làm hệ vi sinh vật có ích trong đất bị thay đổi dẫn đến không có sự điều hòa trong đất trồng, gây nhiều bệnh nguy hiểm cho cây. Trong thực tế, việc thu hoạch sinh khối thực vật hằng năm đã lấy đi của đất nhiều nitơ và các chất dinh dưỡng khác.Mặc dù lượng nitơ, photpho trong đất rất cao nhưng cây trồng lại không thể tự đồng hóa để sử dụng được. Quy trình bổ sung nitơ trong tự nhiên lại quá chậm, trong khi đó, do quay vòng thời vụ lớn lại càng làm thiếu hụt nghiêm trọng các chất cần thiết cho cây trồng. Sự thiếu hụt đó lâu nay được bù đắp bằng phân bón vô cơ (phân hóa học). Việc làm này tuy làm tăng năng suất cho cây trồng tức thời nhưng để lại hậu quả đáng buồn là đất bị chua dần, độ cứng cơ lí tăng dần làm cho đất bị bạc màu và điều nguy hiểm hơn là các chất dư thừa của phân hóa học tích tụ trong đất hoặc thải vào môi trường nước làm cho đất, nước bị ô nhiễm, ảnh hưởng xấu đến hệ sinh thái và môi trường sống.