Không kể đến tình hình thị trường chứng khoán ảm đạm như hiện nay, ở những lúc thị trường được xem là năng động và phát triển nhất như thời gian đầu của năm 2007, thị trường chứng khoán vẫn còn nhiều vấn đề còn tồn tại cần phải khắc phục để thị trường phát triển tốt và bền vững. Điển hình là tình trạng mất cân bằng giữa cung và cầu chứng khoán khá lớn, chính sách điều hành vĩ mô chưa phù hợp với thị trường, hành vi giao dịch của nhà đầu tư còn mang tính bầy đàn khá cao, thông tin về công ty niêm yết còn khá mơ hồ, cơ sở hạ tầng phục vụ thị trường chưa đáp ứng được nhu cầu phát triển, khung pháp lý điều chỉnh chưa bao quát và hiện còn nhiều thay đổi không ổn định, giao dịch nội gián vẫn chưa được răn đe đúng mức, việc đặt hủy lệnh hoặc nhằm “room” còn khá phổ biến v.v.