Theo Bradley và cộng sự (2007), mặc dù chỉ mới có 523 gene và EST cá ngựa vằn được đưa lên bản đồ đã xác nhận được 80% tương đồng với bộ gene người [25]. So với đánh giá trước đây với 124 gene chiếm 64%, điều này cho thấy rằng càng nhiều trình tự của cá ngựa vằn được so sánh, phần trăm tương đồng với bộ gene người sẽ tăng lên và có thể đạt tới 100% trong tương lai. Do đó, cá ngựa vằn đang trở thành sự lựa chọn quan trọng cho nhiều mô hình nghiên cứu. Điều này được thể hiện qua sự gia tăng đáng kể trong số lượng bài báo công bố trên Pubmed trong những năm gần đây, tăng gấp 10 lần so với cách đây một thập kỷ. Khoảng 50% đến 70% các chất hóa học tác động lên chu kỳ tế bào hữu nhũ thì cũng có tác dụng tương tự trên cá ngựa vằn [26]. Trong đó, có những nghiên cứu cho thấy kết quả giống nhau lên đến 95%. Đáng chú ý, khi so sánh trình tự bộ gene người và bộ gen cá ngựa vằn, cho thấy có sự bảo tồn của các gene liên quan đến chu kỳ tế bào, các gene tăng cường hoặc ức chế ung thư và các gene đột biến gây bệnh ung thư (oncogen). Trong các nghiên cứu y học cá ngựa vằn hay được sử dụng, chúng có các đặc điểm như yếu tố về gene, vòng đời ngắn, các đặc điểm thuận lợi về phôi và ấu trùng là trong suốt dễ quan sát, số lượng lớn dễ dàng bố trí thí nghiệm. Trong nghiên cứu khoa học về phát triển thuốc điều trị ung thư, u ác tính và bệnh tim mạch cá ngựa vằn được sử dụng. Trong các nghiên cứu y khoa, nghiên cứu ảnh hưởng của các loại thuốc kháng sinh đến các giai đoạn phát triển của phôi cá ngựa vằn là mô hình hữu ích mô phỏng sự tiếp xúc thụ động của các loại thuốc kháng sinh tác động đến thai nhi. Trong các nghiên cứu sinh học, nghiên cứu ảnh hưởng của các loại hóa chất đóng vai trò là phụ gia thực phẩm, các chất chống oxy hóa, các chất tạo màu, chất bảo quản thực phẩm. Thông tin từ các giai đoạn phát triển khác nhau của phôi và ấu trùng đóng vai trò quan trọng và chính xác trong việc nghiên cứu sự phát triển của loài. Điều này bởi vì các phôi và ấu trùng phát triển theo các tỷ lệ và quá trình khác nhau. Trong các thí nghiệm sử dụng mô hình cá ngựa vằn, có nhiều cấp độ và tiêu chí để đánh giá. Cách đơn giản nhất là đánh giá các tác động của hóa chất lên sự biến đổi về hình thái bên ngoài cũng như biểu hiện bên trong của phôi và ấu trùng. Khi tiếp xúc với các hóa chất độc hại đến một ngưỡng nhất định sẽ ảnh hưởng đến sức sống của phôi và ấu trùng cá ngựa vằn, cũng như gây dị tật, đột biến. Các tiêu chí quan sát để so sánh với nhóm đối chứng rất đa dạng, bao gồm các yếu tố như kích thước của mắt, nhịp tim, hoạt động não bộ, sự phát triển của trứng, và kích thước cơ thể. Dữ liệu thu thập sau khi tiến hành phân tích thống kê và xây dựng các đường cong phản ứng với các nồng độ hóa chất thử nghiệm, từ đó đánh giá các chỉ số độc học như giá trị LC50, là nồng độ của chất thử gây tử vong cho 50% tổng số phôi trong lô thí nghiệm.