Nước thải sản xuất tại Nhà máy chế biến bột cá – Công ty TNHH Quốc Hiệp có đặc trưng ô nhiễm hữu cơ cao. Dưới tác dụng của các VSV có trong nước chúng sẽ phân hủy các chất hữu cơ dễ bay hơi tạo ra các khí sinh học có mùi hôi thối. Do vậy, nhất thiết phải xử lý lượng nước thải này (cùng với phần nước thải sinh hoạt) để đảm bảo nước sau xử lý thải vào nguồn tiếp nhận (sông Ông Đốc) đạt TCVN 5945:2005, loại B.