Năm 1972, ở độ tuổi 32, ông được chỉ định làm giáo sư môn virus học ở Trường Đại học Erlangen-Nuremberg ở Bavaria, Đức. GS zur Hausen bắt đầu nghiên cứu HPV từ năm 1972. Năm 1983, ông đã khám phá HPV đầu tiên, type 16, trong mẫu sinh thiết phụ nữ bị ung thư cổ tử cung, sau đó là type 18.  Phát hiện của GS zur Hausen chính là tiền đề cho sự thành công của các loại vắc xin phòng chống ung thư cổ tử cung hiện đang được hàng triệu em gái vị thành niên ở nhiều quốc gia sử dụng.