Cấu trúc giếng khoan được xác định bằng:  Số lượng các cột ống chống trong giếng khoan  Đường kính và chiều sâu thả các cột ống chống  Đường kính choòng khoan tương ứng dùng khoan để thả các cột ống chống.  Chiều cao dâng của vữa xi măng trong khoảng không gian vành xuyến ống chống. Việc lựa chọn cấu trúc giếng khoan phù hợp phụ thuộc vào các yếu tố cơ bản sau: mục đích giếng khoan và phương pháp khoan, điều kiện địa chất khoan qua, chiều sâu vỉa sản phẩm, số lượng vỉa sản phẩm, phương pháp mở vỉa sản phẩm, khả năng thiết bị kỹ thuật và thực trạng công nghệ. Trong tất cả các trường hợp, cấu trúc giếng khoan phải đảm bảo được khả năng thi công đến chiều sâu thiết kế và đạt được các chỉ tiêu kinh tế kỹ thuật như thiết kế đặt ra. Với mục đích giảm thiểu thời gian thi công và tạo điều kiện tốt cho công tác khoan nhằm phòng ngừa các phức tạp và sự cố trong quá trình khoan nên khi thiết kế cấu trúc giếng khoan cần chú ý đến:  Chiều sâu của đối tượng khai thác (vỉa sản phẩm), sản lượng của chúng và tính thấm, chứa của vỉa.  Tính chất cơ lý và trạng thái gắn kết của đất đá, trong trường hợp thân giếng hở, cần tính tới các phức tạp địa chất có thể xảy ra các hiện tượng như bó, kẹt cần khoan, sập lở, hang hốc, phun trào