Đồng bằng sông Hồng (ĐBSH) và Đồng bằng sông Cửu Long (ĐBSCL) là những vùng sản xuất nông nghiệp chính của cả nước, đặc biệt là sản xuất lúa. Tính chung cả hai vùng, diện tích trồng lúa chiếm khoảng 68% và sản lượng chiếm trên 70% so với cả nước, riêng ĐBSCL còn là nơi sản xuất 95% lượng gạo xuất khẩu của Việt Nam. Theo Cẩm nang Sử dụng đất nông nghiệp (Bộ Nông nghiệp & PTNT, 2009) và số liệu của Tổng cục Thống kê : Diện tích đất trồng lúa ở cả hai vùng giảm đi nhưng diện tích gieo trồng lại tăng lên do hệ số sử dụng đất tăng, từ 1,49 (năm 1990) lên 1,92 (2007). Năng suất lúa tăng từ 35,7 tạ/ha (1990) lên 55,3 tạ/ha (2011). Đạt được những tiến bộ trên là do chúng ta đã áp dụng nhiều biện pháp kỹ thuật, cơ cấu giống cải tiến với các giống lúa cao sản, lúa lai được gieo trồng phổ biến thay thể các giống địa phương năng suất thấp; sử dụng phân bón tăng nhanh, hệ thống tưới tiêu ngày càng hoàn thiện. Tuy nhiên, chúng ta cũng đang phải đối mặt với rất nhiều thách thức do sự xuất hiện của các yếu tố hạn chế (YTHC) độ phì nhiêu đất mà nguyên nhân là do chế độ sử dụng phân bón, canh tác chưa hợp lý, dẫn đến thiếu hụt một số nguyên tố dinh dưỡng trong đất, hay tích lũy trong đất một số nguyên tố gây độc cho cây trồng. Những thay đổi về sử dụng phân bón gần đây, như quá thiên về bón phân hóa học và chủ yếu là bón phân đa lượng (N, P, K), bón không cân đối là những nguyên nhân chủ yếu hình thành các YTHC này.