Quá trình chuẩn bị và xây dựng bản dự thảo Sách Xanh có sự tham gia tích cực của các Bộ ngành Trung ương với sự hợp tác chặt chẽ với Tổ chức Y tế Thế giới, tổ chức lương thực và nông nghiệp thế giới, Chương tình phát triển của Liên Hợp Quốc, quỹ nhi đồng Liên Hợp Quốc và Ngân hàng Thế giới. Dựa trên những văn kiện ban đầu của mỗi ngành bản dự thảo đầu tiên của Sách Xanh được biên soạn và thảo luận trong cuộc hội thảo tổ chức tại Hà Nội vào ngày 12/04/2006, sau đó đã được chỉnh sửa trong khuôn khổ đoàn đánh giá của các nhà tài trợ từ 17-28 tháng 4 năm 2006.