Chi nhánh ngân hàng Nông nghiệp và phát triển nông thôn Hà Nội là đơn vị trực thuộc Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam, được thành lập theo quyết định số 51–QĐ/NH/QĐ ngày 27/06/1988 của tổng giám đốc Ngân hàng Nhà nước Việt Nam hiện nay là thống đốc Ngân hàng Nhà nước Việt Nam. Đến cuối năm 2006 Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp và phát triển nông thôn Hà Nội có 11 phòng ban và 11 chi nhánh cấp 2 trực thuộc, 38 phòng giao dịch hoạt động theo quy chế 454/QĐ/HĐQT–TCCB ngày 24/12/2004 của Hội đồng quản trị Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam. Chi nhánh NHNo&PTNT cấp 2 (gọi tắt là Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp cấp 2) là đơn vị phụ thuộc cho nhánh Ngân hàng Nông nghiệp Hà Nội có con dấu, có nhiệm vụ thực hiện các hoạt động theo uỷ quyền của Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp Hà Nội. Phòng giao dịch: là đơn vị thuộc bộ máy tổ chức chuyên môn, nghiệp vụ trực thuộc chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Hà Nội hoặc Chi nhánh ngân hàng Nông nghiệp cấp 2, không có bản cân đối riêng, có con dấu để sử dụng trong giao dịch, có biển hiệu, có quy trình nghiệp vụ cụ thể chịu sự quản lý toàn diện của Giám đốc Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Hà Nội hoặc Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp cấp 2, thực hiện các nghiệp vụ huy động vốn, cho vay và các dịch vụ ngân hàng khác theo quy định của Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam và của chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp Hà Nội.