Các sản phẩm nông sản có chất lượng vềdinh dưỡng, thành phần hóa học, tính chất cảm quan phụthuộc nhiều vào: giống, loại nông sản, điều kiện canh tác, điều kiện thu hái và vận chuyển, điều kiện bảo quản. Do vậy chất lượng sản phẩm được tạo ra từnguyên liệu dao động rất lớn. Trong thực tếnếu chất lượng nguyên liệu quá kém người ta phải điều khiển các phản ứng xúc tác bởi enzyme đểtạo nên các thành phần thiếu hụt trong nguyên liệu đưa vào sản xuất. Ví dụ: trong sản xuất bia, nguyên liệu chính là malt đại mạch. Đểkhắc phục malt đại mạch chát lượng kém (không có khảnăng chuyển hóa hết tinh bột thành dextrin, đường lên men.) thường dùng các chếphẩm enzyme thủy phân thuộc hệ amilaza nhưTermamyl 120L hoặc SC , hệenzyme proteaza nhưNeutrase 0,5L. Ví dụ: dứa , cà chua khi đưa vào sản xuất có độchín khác nhua, phải qua giai đoạn ủchín đểchuyển hóa protopectin (1 hợp chất pectin có cấu tạo phức tạp, ngoài các chuỗi polygalacturonic còn có các thành phần khác nhưaxit axectic, xenluloza, galactoza, rhamnoza. do đó chúng tạo nên cấu trúc cứng của các loại quả) vềdạng pectin hòa tan nhờenzyme pectinaza. Hoặc sau khi chà sẽ đưa enzyme pectinaza vào đểphá vỡmàng tếbào thực vật giúp tạo ra các vết nứt trên quảtạo thành rãnh thoát dịch chiết ra ngoài làm tăng hiệu suất chiết dịch quả.