Hiện nay, trên thế giới việc chuyển gen vào thực vật đã trở thành kỹ thuật thông dụng trong cải tạo giống cây trồng. Đã có hơn 50 loại gen được chuyển vào thực vật và có khoảng 400 loại cây trồng chuyển gen đã được kiểm tra ngoài đồng ruộng. Nhiều sản phẩm chuyển gen đang được tiêu thụ trên thị trường như bông, ngô, đậu tương có khả năng kháng sâu, kháng chất diệt cỏ, cải dầu có thành phần dầu thay đổi, cà chua chín chậm v.v Ở nước ta, một số phòng thí nghiệm đã và đang áp dụng kỹ thuật chuyển gen để cải tạo nhiều loại giống cây trồng khác nhau. Trong đó, Phòng Công nghệ Tế bào Thực vật, Viện Công nghệ Sinh học là một trong những đơn vị đang tiến hành theo hướng nghiên cứu này. Cho đến nay, phòng đã tạo ra được một số dòng cây chuyển gen và đang đưa vào phân tích. Bên cạnh những đánh giá sự biểu hiện của gen chuyển như chịu hạn, mặn, kháng sâu, kháng bệnh, những phân tích phân tử cũng được tiến hành. Cho đến nay, kết quả phân tích phân tử cây chuyển gen chỉ dừng lại bằng sử dụng kỹ thuật PCR. Lai Southern là kỹ thuật quan trọng, có giá trị khẳng định sự có mặt của gen chuyển. Ngoài ra, với kỹ thuật này mới có thể đánh giá chính xác số điểm gắn của gen chuyển, thông qua đó có thể phân tích được sự liên quan giữa mức biểu hiện và kiểu gắn của gen chuyển. Nhằm đưa quy trình lai Southern vào mục đích đánh giá cây chuyển gen, chúng tôi sử dụng các dòng bông kháng sâu làm nguyên liệu nghiên cứu và áp dụng hệ thống phi phóng xạ DIG để kiểm tra phân tích gen CryIA. Bản khoá luận này báo cáo lại những kết quả nghiên cứu bước đầu về sử dụng kỹ thuật lai Southern trong phân tích cây chuyển gen. Đây là tiền đề cho các phân tích phân tử tiếp theo đối với các cây chuyển gen khác đã và đang được tạo ra.