Một trong những lo ngại lớn đối với ngành chăn nuôi hiện nay, đặc biệt là ngành chăn nuôi heo ở Việt Nam là heo con thƣờng mắc phải những bệnh truyền nhiễm có thể gây chết ở tỉ lệ cao. Bệnh thƣờng gặp nhất là chứng tiêu chảy trên heo con mà nguyên nhân chủ yếu là do vi khuẩn E. coli gây ra làm thiệt hại lớn cho ngƣời chăn nuôi và còn ảnh hƣởng lớn đến nền kinh tế của cả nƣớc. Phƣơng pháp điều trị hiệu quả đối với bệnh tiêu chảy trên heo phổ biến nhất là sử dụng kháng sinh. Tuy nhiên do mức độ nguy hiểm của kháng sinh đối với môi trƣờng và con ngƣời cùng với khả năng gây hiện tƣợng “lờn thuốc” ở các vi sinh vật gây bệnh mà kháng sinh ngày càng bị hạn chế sử dụng. Thay vào đó, việc sử dụng probiotic ngày càng phổ biến. Probiotic là một dạng chế phẩm sinh học bao gồm các vi sinh vật có lợi, có tính đề kháng cao, có khả năng ức chế các vi sinh vật có hại nên đƣợc ứng dụng để phòng trừ bệnh tiêu chảy trên heo con. Ngoài ra, probiotic còn giúp cải thiện tốt các quá trình tiêu hóa hay những sản phẩm do quá trình lên men giúp cung cấp chất dinh dƣỡng (protein, vitamin, ) giúp nân g cao sức đề kháng và tăng trọng cho heo con Hiện nay, các dạng chế phẩm sinh học từ Bacillus subtilis đang đƣợc sử dụng ngày càng phổ biến đối với bệnh tiêu chảy trên heo do những ƣu điểm thuận lợi cho việc sản xuất probiotic cũng nhƣ tính đối kháng mạnh với E. coli. Nhiều nghiên cứu trong và ngoài nƣớc về Bacillus subtilis đã và đang đƣợc tiến hành nhằm tìm ra những chủng Bacillus subtilis có khả năng đối kháng mạnh với E. coli