Mục tiêu trọng tâm là phòng ngừa, phát hiện và xử lý các hành vi vi phạm pháp luật về bảo vệ môi trường. Phát hiện những sơ hở trong cơ chế quản lý, chính sách, pháp luật về bảo vệ môi trường để kiến nghị với cơ quan nhà nước có thẩm quyền. Đưa ra các biện pháp khắc phục góp phần nâng cao hiệu lực, hiệu quả của quản lý nhà nước về bảo vệ môi trường.