Hiện nay,thủy sản sau khi thu hoạch được bảo quản chủ yếu bằng phương pháp ướp đá với một trong hai cách truyền thống:dùng đá xay(phủ một lớp thủy sản ,một lớp đá) hoặc cho thủy sản vào túi nilon rồi ướp đá.Điểm hạn chế của phương pháp ướp đá chính là :các dụng cụ bảo quản thường là đồ gỗ hoặc nhựa ,xốp rất khó làm vệ sinh.Vì thế,các dụng cụ trở thành môi trường lí tưỡng cho vsv có hại phát triển và gây thối nguyên liệu .
Trong lĩnh vực nuôi trồng ,việc nuôi tự phát ,nhỏ lẽ,thiếu quy hoạch cũng là nguyên nhân dẩn đến việc bảo quản không đảm bảo vệ sinh,cách thức bảo quản không đúng ,thiết bị vận chuyển không đạt yêu cầu về nhiệt độ trong suốt quá trình vận chuyển .Thêm vào đó người dân sử dụng tùy tiện các chất bảo quản,không tuân theo quy định của Nhà nước .là những thách thức lớn đối với đối với các nhà chế biến .Nhất là khi sản phẩm xuất sang thị trường khó tính như Nhật.Mỹ.EU .
Việc bảo quản nguyên liệu thủy sản sau khi thu hoạch không tốt dẩn đến chất lượng sản phẩm thấp,không thể sử dụng cho việc chế biến xuất khẩu.Tình trạng thiếu nguyên liệu trầm trọng khiên cho các nhà sản xuất xoay sang nhập khẩu nguyên liệu từ nước ngoài ,làm tăng thêm chi phí sản xuất giảm hiệu quả kinh tế .Dây chính là vòng luẩn quẩn ,gây thiệt hại không nhỏ cho ngành sản xuât thủy sản của nước ta.