Đồng bằng Sông Cửu Long (ĐBSCL) nói chung và Bán đảo Cà Mau (BĐCM)
nói riêng là một phần của Lưu vực Mê Công [25], chịu ảnh hưởng mạnh mẽ của các
điều kiện tự nhiên và phát triển trên lưu vực [69], [73], [26]. Chế độ nước (chế độ động
lực, lượng và chất) trong vùng Bán đảo Cà Mau là sự tổ hợp tác động của các loại nguồn
nước thành phần khác nhau và rất phức tạp [18]. Do chịu tác động của triều ở các biên
Biển Đông và Biển Tây nên gần như toàn bộ vùng BĐCM chịu ảnh hưởng của triều
[66].
Vùng BĐCM chịu tác động mạnh mẽ của các hoạt động phát triển kinh tế – xã
hội, quá trình đô thị hóa diễn ra nhanh chóng, dân số tăng nhanh. Hơn nữa, các hoạt
động kinh tế đã làm phát sinh các nguồn thải gây ô nhiễm môi trường trong nhiều khu
vực. Các vùng chịu sự suy thoái nguồn nước mặt là các vùng chuyển đổi mô hình sản
xuất từ trồng trọt sang nuôi tôm, hay các khu/cụm công nghiệp, dịch vụ và các khu dân
cư đông đúc (thành phố, thị xã.) [66], [72].
Từ 1999-2000 đến nay, vùng Bán đảo Cà Mau đã có sự chuyển đổi sản xuất
nhanh, nhất là từ sinh thái ngọt sang sinh thái mặn (trồng lúa sang nuôi tôm) dẫn đến hạ
tầng phục vụ không theo kịp, đặc biệt là hạ tầng thủy lợi. Việc kiểm soát nguồn nước
trước đây chủ yếu nhằm sử dụng cho nông nghiệp, nay thêm cả nuôi trồng thủy sản nên
đã bộc lộ nhiều hạn chế, bất cập nhất là về chất lượng nước bị suy giảm [66], [44].
Theo kết quả giám sát chất lượng nước mặt trên hệ thống sông kênh trong vùng
BĐCM của các Sở Tài nguyên và Môi trường các tỉnh trong vùng nghiên cứu cho thấy
nguồn nước mặt trong vùng bị ô nhiễm phổ biến là hữu cơ và vi sinh với các thông số
DO, BOD5, COD, NH4+, tổng Coliform, vượt từ 2 đến 12 lần tiêu chuẩn cho phép
[50], [55], [58], [47] , [59].