Giả sử toàn bộ lưu lượng tàu được coi là một phân tử (molecule), cụ thể là phân tử lưu lượng tàu (ship traffic molecule), trong đó các tàu trong lưu lượng tàu được giả định là các nguyên tử (atom) (Hình 2.9). Để lập mô hình vùng an toàn thể hiện mật độ xung quanh một nguyên tử tàu cần phải biểu thị mật độ ở các khoảng cách khác nhau tính từ hạt trung tâm. Khoảng cách được coi là một tham số quan trọng cần thiết cho vùng an toàn. Càng có nhiều tàu xung quanh ở khoảng cách liền kề thì mật độ xung quanh tàu trung tâm sẽ càng lớn. Khoảng cách là yếu tố quan trọng nhất trong việc xác định mật độ xung quanh một nguyên tử nhất định, bởi vì vùng an toàn mới được xây dựng với sự phân bố của các hạt dựa trên khoảng cách và nó đánh giá trạng thái phân bố xung quanh một hạt. Đối với hệ thống giao thông hàng hải, khoảng cách cũng là một thông số quan trọng. Nó có thể ảnh hưởng đến mật độ tàu, và là thước đo cơ bản lưu lượng tàu để mô tả tình hình giao thông. Nói chung, khoảng cách càng nhỏ, mật độ tàu càng lớn và lưu lượng tàu càng đông đúc. Vì vậy, ta phải xác định được mật độ của các nguyên tử xung quanh tàu ở các khoảng cách rủi ro khác nhau. Do giao thông hàng hải được hình thành trên mặt nước nên hệ thống phân tử lưu lượng tàu nên được coi là một hệ thống các nguyên tử tàu được sắp xếp trong không gian hai chiều. Quá trình tính toán liên quan cần được quy đổi về diện tích hình tròn. Theo lý thuyết trường, khi tốc độ tương đối không đổi, nguy cơ đâm va của mọi điểm trong khoảng Δr đối với tàu chủ là như nhau vì khoảng cách bằng nhau.