Tại các viện nghiên cứu, đội ngũ cán bộ khoa học đã được tang cường về số lượng, nâng cao về chất lượng và hoạt động năng động, sáng tạo hơn trong cơ chế mới. Chẳng hạn như tại Viện Nghiên cứu Châu Phi và Trung Đông, năm 2017 theo số liệu thống kê, số cán bộ có trình độ đại học trở lên chiếm 96% trong đó số phóa giáo sư và tiến sĩ chiếm 33%, thạc sĩ chiếm 48% còn lại là trình độ khác. So với thời kỳ đầu thành lập, chất lượng nguồn nhân lực ở Viện Nghiên cứu Châu Phi và Trung Đông đã được nâng cao rõ rệt, góp phần tích cực vào sự phát triển chung của Viện. Tuy nhiên, so với những yêu cầu của công cuộc công nghiệp hóa – hiện đại hóa đất nước, nhất là trong xu thế Việt Nam đang tiến hành hội nhập sâu vào nền kinh tế thế giới đòi hỏi các cán bộkhoa học của các viện nghiên cứu nói chung, và Viện Nghiên cứu Châu Phi và Trung Đông nói riêng phải có trình độtrí tuệngang tầm với khu vực và quốc tế, thì nguồn nhân lực của Viện Nghiên cứu Châu Phi và Trung Đông vẫn còn có nhiều điểm hạn chế, thể hiện ở một số khía cạnh: 1) Lực lượng này còn quá nhỏ bé so với yêu cầu thực tế của sự phát triển kinh tế – xã hội và quan hệ Việt Nam với khu vực châu Phi và Trung Đông; 2) Trình độ đội ngũ cán bộkhoa học công nghệ nước ta hiện nay còn nhiều bất cập, chưa đáp ứng được yêu cầu của công nghiệp hóa – hiện đại hóa, nhất là yêu cầu đi tắt đón đầu về công nghệ; 3) Đội ngũ cán bộnghiên cứu còn phân tán, thiếu tập trung với một bộphận không nhỏ còn chưa tận tâm với nghiên cứu khoa học.