Trên người mang HBV mạn tính, đột biến Precore (PC) và đột biến basal core promoter (BCP) được hình thành dần dần theo thời gian nhiễm HBV dưới áp lực miễn dịch của cơ thể chủ. Khi chủng HBV mang đột biến trở nên ưu thế hoàn toàn, hoạt động kiểm soát miễn dịch với HBV không còn hữu hiệu, siêu vi tái hoạt và kích thích hệ miễn dịch như một chủng HBV mới, gây những đợt thải trừ miễn dịch làm cho diễn tiến bệnh gan không ổn định, dẫn đến suy gan và biến chứng xơ gan, ung thư gan (HCC). Theo các nghiên cứu đã thực hiện, đột biến G1896A chiếm ưu thế hơn ở vùng phân bố của genotype B và D (93% ở Trung Đông, 52% ở Châu Á Thái Bình Dương); đột biến A1762T/G1764A ưu thế hơn ở vùng lưu hành của genotype C. Cho đến nay, dữ liệu về tỷ lệ đột biến được công bố có nhiều khác nhau giữa các nghiên cứu có lẽ do khác nhau về tỷ lệ của các yếu tố như nhóm tuổi, genotype, mức độ bệnh lý gan, giai đoạn diễn biến nhiễm HBV, HBV DNA và giai đoạn có biến chứng xơ gan, HCC.